Since Google Wave took out EtherPad, they at least made is OSS, so places like PiratePad.net can now use it for free. You can roll your own or see if anyone made a secured version.<br><br>Running your own IRCd within the intranet where folks can VPN in is also an option as mentioned. In combination with a good wiki and perhaps a twitter like thought stream service you have your bases covered. <br>
<br>There are also several start-ups offering product suites for collab. and file sharing so you don't have to roll your own. One I recall is <a href="http://egnyte.com">egnyte.com</a>, but take a look at a few.<br><br>
-- Rob<br>